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| 類型 | 年度 | 獎項名稱 | 得獎人 | 頒獎單位 |
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| 校外榮譽 | 2015 | 優秀論文獎 (2015-2016) | 吳泓璁《關於我》 | 國立成功大學醫學院附設醫院 |
| 校外榮譽 | 2015 | Postdoctoral Research Abroad Program, MOST, Taiwan (declined) | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2015 | JSPS Postdoctoral Fellowship for Overseas Researchers, JSPS, Japan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2014 | 口頭報告評選比賽第一名 | 吳泓璁《關於我》 | 台灣肥胖醫學會 |
| 校外榮譽 | 2014 | 衛生福利部國民健康署健康促進醫院創意計畫選拔─老年健康類 | 劉燦宏《關於我》 | 衛生福利部國民健康署 |
| 校外榮譽 | 2014 | 衛生福利部衛生福利專業獎章三等獎章 | 劉燦宏《關於我》 | 衛生福利部 |
| 校外榮譽 | 2014 | 行政院經濟部智慧財產局103年度國家發明創作獎 -發明獎銀牌 | 黃啟彰《關於我》 | 行政院經濟部智慧財產局 |
| 校外榮譽 | 2014 | 新北市第3屆醫療公益獎 | 劉燦宏《關於我》 | 新北市政府 |
| 校內榮譽 | 2014 | 第四屆運動科技應用論文競賽 -佳作 | 黃啟彰《關於我》 | 國立體育大學 |
| 校內榮譽 | 2014 | 臺北醫學大學103年度『優良研究計劃獎』 | 劉燦宏《關於我》 | 臺北醫學大學 |
| 校內榮譽 | 2014 | 臺北醫學大學103年度學術研究獎之『臨床研究獎』 | 劉燦宏《關於我》 | 臺北醫學大學 |
| 校外榮譽 | 2014 | 行政院教育部體育署 -103年度運動科學研究及發展獎勵 -佳作 | 黃啟彰《關於我》 | 行政院教育部體育署 |
| 校外榮譽 | 2014 | Poster award from 2014 TPS Translational and Systems Biology Symposium, Taipei, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2013 | Dean Award, College of Life Science, National Taiwan University, Taipei, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2013 | 台灣生物化學及分子生物學學會2013年口頭論文比賽中，獲評審為第三名 | 童鈺棠《關於我》 | 台灣生物化學及分子生物學學會 |
| 校外榮譽 | 2013 | 101年度博士後研究人員學術著作獎 | 童鈺棠《關於我》 | 科技部 |
| 校外榮譽 | 2013 | The Third Place in the poster award at Taiwan Proteomics Society International Conference: Recent Advances in Translational Medicine, Taipei, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2013 | The First Prize in the poster competition award at the 18th Biophysics Conference, Taipei, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2013 | Selected participants for the 5th HOPE meeting with Nobel Laureates, Tokyo, Japan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2013 | 行政院教育部體育署 -102年度運動科學研究及發展獎勵 -優等獎 | 黃啟彰《關於我》 | 行政院教育部體育署 |
