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| 類型 | 年度 | 獎項名稱 | 得獎人 | 頒獎單位 |
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| 校內榮譽 | 2009 | Excellent Teacher | 楊素卿《關於我》 | 臺北醫學大學 |
| 校外榮譽 | 2009 | 國立臺灣大學生物資源暨農學院學生論文評鑑，獲得「學生學術論文獎」 | 童鈺棠《關於我》 | 國立臺灣大學 |
| 校內榮譽 | 2008 | Excellent Teacher | 楊素卿《關於我》 | 臺北醫學大學 |
| 校外榮譽 | 2008 | 行政院科技部補助大專校院獎勵特殊優秀人才措施獎勵(彈性薪資) (2008~2018) | 黃士懿《關於我》 | 科技部 |
| 校內榮譽 | 2008 | 96學年度師鐸獎 | 黃士懿《關於我》 | 臺北醫學大學 |
| 校外榮譽 | 2008 | Travel award (oral presentation) from the 4th International Meeting on Synthetic Biology (SB4.0), Hong Kong, China | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2008 | Poster award from the 5th annual conference of Prof. Lin JY. Foundation, Kaohsiung, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2008 | Poster award from the poster competition of Institute of Molecular and Cellular Biology, National Taiwan University, Taipei, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2007 | 營養學術研究傑出獎 (2007) | 黃士懿《關於我》 | 台灣營養學會 |
| 校外榮譽 | 2007 | Poster award from the Autumn Camp Symposium of The Taiwan Society for Biochemistry and Molecular Biology (TSBMB), Hsinchu, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2007 | 科技部獎勵特殊優秀人才 (2007-2014) | 許準榕《關於我》 | 科技部 |
| 校外榮譽 | 2006 | Gold Medal for the Entire GPA (2002-2006), Department of Life Science, National Taiwan Normal University, Taipei, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2006 | First Class Honors-B.S., Department of Life Science, National Taiwan Normal University, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校內榮譽 | 2005 | Excellent Paper, Cerebos Taiwan LTD | 楊素卿《關於我》 | 臺北醫學大學 |
| 校外榮譽 | 2005 | Poster award from the 20th Joint Annual Conference of Biomedical Sciences, Taipei, Taiwan | 張心儀《關於我》 | |
| 校外榮譽 | 2005 | 中華林學會九十四年度森林學術論文發表會，於林產組論文比賽中，獲評審為第一名 | 童鈺棠《關於我》 | 中華林學會 |
| 校外榮譽 | 2004 | 中華林學會九十三年度森林學術論文發表會，於林產組「論文海報」比賽中，獲評審為第一名 | 童鈺棠《關於我》 | 中華林學會 |
| 校外榮譽 | 2004 | 中華林學會九十三年度森林學術論文發表會，於林產組論文比賽中，獲評審為第一名 | 童鈺棠《關於我》 | 中華林學會 |
| 校內榮譽 | 2004 | Excellent Teacher | 楊素卿《關於我》 | 臺北醫學大學 |
| 校內榮譽 | 2003 | Excellent Paper, The symposium of Teachers and Students | 楊素卿《關於我》 | 臺北醫學大學 |
